【徹底調査】菌活 サプリのおすすめ人気ランキング2026｜独自アンケートも公開！

健康維持や美容効果を期待して「菌活」を始めたいけれど、どのサプリメントが効果的なのかわからないとお悩みの方も多いのではないでしょうか。実は、多くの菌活サプリには種類や効果、価格などさまざまな選び方のポイントがあります。そこで、今回の徹底調査では、人気の菌活サプリランキングをはじめ、独自アンケートの結果を公開し、皆さんの選択をサポートします。あなたの目的やライフスタイルにぴったり合った菌活サプリを見つけるために、ぜひこの記事をご活用ください！健康や美のために、正しい選択をして自信を持って毎日を過ごしましょう。ぜひ参考にしてください！

※一部記事は専門家やプロのアドバイス・監修を受けています。一部のコンテンツにプロモーションを含みます。

菌活 サプリの選び方

菌活サプリは目的や生活スタイルに合わせて選ぶことで、効果的に健康維持をサポートします。初心者の方でもわかりやすく、使いやすく続けられるよう、目的と置き場所などの現実的な制約を考慮した選び方のポイントをご紹介します。

体調改善や美容など、目的に合った菌の種類を選ぶ

菌活サプリは種類ごとに異なる効果が期待できます。例えば、便秘改善にはビフィズス菌、免疫力アップには乳酸菌が適しています。自分の体調や美容の目的に合った菌が含まれているかを確認することが重要です。成分表示をチェックし、目的に合う菌を選びましょう。

1回あたりの菌数（菌量）を確認し、効果を実感しやすいものを選ぶ

菌活サプリは菌の量が多いほど効果が出やすい傾向にあります。一般的に数十億〜数百億個の菌が1回分に含まれているかが目安。菌の量が適切であるほど、体内でしっかり働きやすく効果を実感しやすいです。初心者は特に菌数の記載を参考にしましょう。

持ち運びやすさと保管のしやすさで選ぶ

サプリは続けやすさが大切です。小分け包装や錠剤のサイズが小さいものは、外出先でも摂取しやすく便利です。また、冷蔵保存が必要かどうか、常温で保存できるかも確認し、日常生活の中で無理なく置ける場所を確保できるものを選びましょう。

価格と摂取回数のバランスを考慮する

菌活を継続するためには、無理なく続けられる価格帯が大切です。1日の摂取回数や1回あたりの量を踏まえ、コストパフォーマンスをチェックしましょう。高価でも効果が高ければ問題ありませんが、日々の続けやすさを優先し、予算に合った商品を選ぶのがポイントです。

菌活サプリは目的に合った菌の種類や菌数、生活環境に合った保管方法や持ち運びやすさを考慮することで、無理なく効果的に続けられます。価格とのバランスも見て、自分に合った一品を選びましょう。

【早見わかり】菌活 サプリのおすすめ比較表

※このランキングは、独自アンケート調査によるユーザー評価スコアと編集部による調査や検証結果を総合して順位付けをしています

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商品名	画像	価格	ブランド	キャッチコピー	ユーザー評価	菌の種類と配合量	形状と飲みやすさ	保存方法とサイズ	添加物の有無	菌の種類と数	飲みやすさ・味	成分の安全性	効果が出るまでの期間	保存方法の簡単さ	腹痛やお腹の調子への影響	詳細記事
1位：新日本ヘルス 菌活届くEX		¥1,380	新日本ヘルス	5兆個の生きた菌で毎朝スッキリ腸活サポート	★4.6点	多種菌配合で腸内環境サポート	噛んで食べられるヨーグルト味が便利	国内GMP工場製で安心、60粒入り	添加物不使用の自然派サプリ	4.8	4.5	4.7	3.8	4.2	4.0	詳細レビュー
2位：DUEN 菌活善菌サプリ 30粒		¥590	DUEN	5兆個の乳酸菌で毎日の菌活を強力サポート	★4.5点	乳酸菌とビフィズス菌など多種類配合	ソフトカプセルで飲みやすい	30粒入りで携帯しやすい	添加物不使用の安心設計	4.8	3.8	4.6	4.4	3.9	4.2	詳細レビュー
3位：悩み解決ラボ BIFIRAL 乳酸菌サプリ 30日…		¥1,680	悩み解決ラボ	4.5兆個の生きた善玉菌で腸内美活をサポート！	★4.3点	4.5兆個の多菌種で効果実感しやすい	耐酸性カプセルで飲みやすく続けやすい	30粒入りで持ち運び便利、保存も簡単	安心の国内製造、添加物不使用	4.7	4.2	4.6	3.6	3.8	4.1	詳細レビュー
4位：pure nature BIOERE 乳酸菌サプリ…		¥1,440	pure nature	4.5兆個の菌で腸まで届く安心菌活サプリ	★4.3点	4.5兆個の乳酸菌と酪酸菌を配合	耐酸性カプセルで飲みやすい	30粒入りで携帯しやすい	無添加で安心して摂取できる	4.7	3.6	4.6	3.7	3.8	4.0	詳細レビュー
5位：Itolo 乳酸菌ビフィズス菌酪酸菌サプリ60粒		¥1,980	Itolo	6兆個の乳酸菌で毎日すっきり菌活サポート	★4.3点	17種の乳酸菌と5種のビフィズス菌を贅沢に配合	粒タイプで飲みやすく続けやすい設計	涼しい場所で保管、60粒入りのコンパクトサイズ	無添加で安心して摂取できる	4.7	3.8	4.6	4.2	3.9	4.3	詳細レビュー
6位：DAY AFTER… 乳酸菌サプリ 1袋		¥1,332	DAY AFTER…(デーアフター)	32種の菌と美活成分で理想の腸活をサポート	★4.1点	32種の乳酸菌と善玉菌をバランス良く配合	ヨーグルト風味で飲みやすい粒タイプ	国内GMP工場製で適切な保存が可能	添加物不使用で安心して続けられる	4.7	4.3	4.6	3.7	3.9	3.8	詳細レビュー
7位：菌トレ習慣 乳酸菌サプリ 30日分		¥1,316	菌トレ習慣	3兆個の乳酸菌で毎日の菌活を強力サポート	★3.8点	多種類の乳酸菌と善玉菌サポート成分を配合	ヨーグルト味の小粒で飲みやすい	冷暗所保存でコンパクトなサイズ	自然な成分で添加物不使用	4.7	4.3	4.5	3.3	3.2	3.5	詳細レビュー
8位：DUEN 腸活善菌 便通改善サプリ		¥690	DUEN	生きた乳酸菌で腸から健康サポート！	★3.8点	有胞子性乳酸菌1億個配合で効果的	飲みやすいサイズで続けやすい	30日分で手軽に管理できる	無添加で安心して摂取できる	4.6	3.5	4.3	3.8	3.7	3.9	詳細レビュー
9位：悩み解決ラボ ビフィラル 酪酸菌サプリ 30日分		¥1,980	悩み解決ラボ	生きた酪酸菌で腸内フローラを徹底サポート	★3.7点	酪酸菌30億個と多種菌で腸内環境を強化	耐酸性カプセルで飲みやすく続けやすい	直射日光・高温避けて30粒を管理	乳成分や大豆含むため注意が必要	4.7	3.2	4.5	3.3	3.5	3.8	–
10位：酪酸菌Rich 菌活サプリ		¥1,180	酪酸菌Rich	高濃度酪酸菌で腸も美容もサポート！	★3.5点	酪酸菌中心で8億個配合し効果的	粒タイプで飲みやすい設計	30日分で手軽に管理できる	自然成分中心で安心して摂取	3.2	3.8	3.5	3.4	3.3	3.5	–
11位：morinaga 生きて届くビフィズス菌BB536…		¥1,388	morinaga	森永乳業の50年研究！生きて届くビフィズス菌で腸活サポート	★3.9点	ビフィズス菌BB536のみのシンプル配合	小粒で飲みやすいカプセルタイプ	直射日光避けて常温保存、コンパクトなサイズ	添加物不使用で安心安全	4.6	3.8	4.0	3.9	3.5	4.4	詳細レビュー
12位：新日本ヘルス 炭と菌のすっきり生酵素 30粒		¥980	新日本ヘルス	498種の酵素と菌で内側からすっきり美活！	★3.8点	多種類の乳酸菌と植物発酵エキスを配合	粒タイプで飲みやすく続けやすい	国内GMP工場製で安心の30粒パック	天然成分中心で添加物不使用	4.7	3.3	4.5	3.4	3.8	3.6	詳細レビュー
13位：菌トレ習慣 菌トレ習慣 HYPER 乳酸菌サプリメ…		¥2,086	菌トレ習慣	20兆個の乳酸菌で腸内美活をサポート	★3.8点	20兆個の乳酸菌と酪酸菌を配合	ヨーグルト風味の小粒タブレット	30日分で手軽に管理できるサイズ	善玉菌サポート成分豊富で安心	4.7	4.5	4.4	3.5	3.3	3.6	–
14位：DMJえがお生活 わたしの菌活きのこ粒		¥1,224	DMJえがお生活	13種きのこで続ける菌活サポート！	★3.8点	多種類のキノコをバランス良く配合	小粒で飲みやすく続けやすい	日本製で長期保存に適したサイズ	自然素材中心で添加物不使用	4.5	4.6	4.3	3.5	3.8	3.7	–
15位：MyWellsy 乳酸菌ビフィズス菌サプリ 30日…		¥1,460	MyWellsy	5兆個の菌で手軽に続ける本格菌活サプリ	★3.8点	28種類の菌と5兆個の高配合量	耐酸性カプセルで飲みやすい	30日分で手軽に管理できる	自然由来成分中心で添加物少なめ	4.7	3.5	4.5	3.6	3.8	3.9	詳細レビュー

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菌活 サプリのおすすめランキング

※このランキングは、独自アンケート調査によるユーザー評価スコアと編集部による調査や検証結果を総合して順位付けをしています

1位：新日本ヘルス 菌活届くEX

5兆個の生きた菌で毎朝スッキリ腸活サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第1位は「新日本ヘルス 菌活届くEX」です。

▼商品概要
本商品は、菌活や腸活をサポートするために設計されたサプリメントです。1袋で5兆個もの乳酸菌やビフィズス菌、酪酸菌など多種多様な善玉菌を補給でき、さらに善玉菌のエサとなるイヌリンを9,000mg配合しています。ヨーグルト約500個分に相当する菌数を生きたまま腸まで届けることができる点が最大の特徴です。水なしでも食べやすいヨーグルト風味のチュアブルタイプで毎日の菌活が負担にならず続けやすく、医師監修のもと品質管理も徹底されているため安心して利用できます。内側からスッキリとした腸環境を整え、健やかな毎日を目指す方に最適です。

2位：DUEN 菌活善菌サプリ 30粒

5兆個の乳酸菌で毎日の菌活を強力サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第2位は「DUEN 菌活善菌サプリ 30粒」です。

▼商品概要
本商品は、毎日の菌活を強力にサポートするサプリメントです。5兆個の乳酸菌に加え、健康維持に欠かせないビフィズス菌や酪酸菌を贅沢に配合し、さらにオリゴ糖と食物繊維が善玉菌の活動を助けます。日々の生活に取り入れることで、腸内環境を整え、健康的な身体作りに役立ちます。国内のGMP認定工場で製造されているため、安全性と品質も信頼できるのが魅力です。菌活を始めたい方にぴったりのサプリメントです。

3位：悩み解決ラボ BIFIRAL 乳酸菌サプリ 30日分

4.5兆個の生きた善玉菌で腸内美活をサポート！

菌活 サプリのおすすめランキングの第3位は「悩み解決ラボ BIFIRAL 乳酸菌サプリ 30日分」です。

▼商品概要
本商品は「菌活 サプリ」として、乳酸菌・ビフィズス菌・酪酸菌をバランスよく4.5兆個も配合したBIFIRALサプリメントです。1日1粒でヨーグルト約450個分の乳酸菌を手軽に摂取でき、生きた善玉菌を耐酸性カプセルで胃酸から守り、腸までしっかり届けるため、腸内環境の改善や健康維持に役立ちます。国内GMP認定工場での製造により安心して続けられる品質も魅力。菌活を始めたい方や腸内フローラを整えたい方に特におすすめのサプリメントです。

4位：pure nature BIOERE 乳酸菌サプリ 30日分

4.5兆個の菌で腸まで届く安心菌活サプリ

菌活 サプリのおすすめランキングの第4位は「pure nature BIOERE 乳酸菌サプリ 30日分」です。

▼商品概要
本商品は、4.5兆個の乳酸菌に加え、酪酸菌やビフィズス菌、ナットウキナーゼなど多彩な成分を配合した菌活サプリメントです。耐酸性カプセルで生きた菌を腸までしっかり届け、体内フローラのバランスをサポートします。国内GMP認定工場で製造されており、15種の無添加で体にやさしいのも魅力。毎日の菌活を手軽に続けたい方に最適な健康習慣を支えるサプリメントです。

5位：Itolo 乳酸菌ビフィズス菌酪酸菌サプリ60粒

6兆個の乳酸菌で毎日すっきり菌活サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第5位は「Itolo 乳酸菌ビフィズス菌酪酸菌サプリ60粒」です。

▼商品概要
本商品は、ltoloが提供する乳酸菌・ビフィズス菌・酪酸菌を贅沢に配合した菌活サプリメントです。ヨーグルト約4,000個分に相当する6兆個の善玉菌を1袋に凝縮し、さらに日本古来のすんき漬や味噌由来の乳酸菌も含まれています。17種類の乳酸菌と5種類のビフィズス菌をバランスよく配合し、善玉菌のエサとなるオリゴ糖やイヌリン、ナットウキナーゼなどの成分で体内フローラをしっかりサポート。1日2粒で手軽に菌活を始めたい方に最適で、国内GMP認定工場での製造により安心して続けられます。毎日すっきりとした健康維持を目指す方におすすめのサプリメントです。

6位：DAY AFTER… 乳酸菌サプリ 1袋

32種の菌と美活成分で理想の腸活をサポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第6位は「DAY AFTER… 乳酸菌サプリ 1袋」です。

▼商品概要
本商品は、1日1粒で手軽に32種の乳酸菌と5兆個の腸活菌を摂取できるサプリメントです。特に菌活を意識する方に向けて、「シールド乳酸菌M-1」「シンデレラ乳酸菌」などの多彩な活性菌を配合し、腸内環境のバランスを整えます。さらに、美容成分のコラーゲンやヒアルロン酸、健康を支えるナットウキナーゼやプロポリスも含まれており、体の内側から美活と健康をサポート。粒サイズは従来より小さく、ヨーグルト風味で続けやすい工夫がされています。毎日の菌活を無理なく続けたい方に最適なサプリメントです。

7位：菌トレ習慣 乳酸菌サプリ 30日分

3兆個の乳酸菌で毎日の菌活を強力サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第7位は「菌トレ習慣 乳酸菌サプリ 30日分」です。

▼商品概要
本商品は、毎日の菌活を効率よくサポートするサプリメントです。1袋にビフィズス菌、乳酸菌、ラブレ菌、ガセリ菌の4種類を含む3兆個の乳酸菌を配合し、1日たった2粒で手軽に善玉菌を増やすことが可能です。さらに、乳酸菌のエサとなるオリゴ糖や食物繊維、ラクトフェリン、イヌリンなど善玉菌の働きを支える成分も豊富に含まれており、腸内環境を整えたい方に最適です。ヨーグルト味で飲みやすく続けやすい点も魅力で、品質管理が徹底された国内GMP認定工場で生産されているため安心して毎日の菌活に取り入れられます。

8位：DUEN 腸活善菌 便通改善サプリ

生きた乳酸菌で腸から健康サポート！

菌活 サプリのおすすめランキングの第8位は「DUEN 腸活善菌 便通改善サプリ」です。

▼商品概要
本商品は、菌活サプリとして腸内環境を整えたい方に最適なサプリメントです。有胞子性乳酸菌（Weizmannia coagulans SANK70258）を1億個配合し、腸まで生きたまま届くことで便通の改善に役立ちます。さらにビフィズス菌と食物繊維も含まれており、腸内の善玉菌を増やして健康的な腸活をサポートします。科学的根拠に基づく機能性表示食品であるため、安心して継続的に摂取できる点も魅力です。毎日の菌活に取り入れて、快適な毎日を目指しましょう。

9位：悩み解決ラボ ビフィラル 酪酸菌サプリ 30日分

生きた酪酸菌で腸内フローラを徹底サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第9位は「悩み解決ラボ ビフィラル 酪酸菌サプリ 30日分」です。

▼商品概要
本商品は、菌活サプリメントとして最適な【生きた酪酸菌 30億個贅沢配合】ビフィラル 酪酸菌サプリです。善玉菌の代表であるビフィズス菌や乳酸菌を多数配合し、さらに貴重な酪酸菌を30億個も1袋に含有しています。耐酸性カプセルの採用により、生きた菌が胃酸で死滅せず腸まで届くため、体内フローラの環境をしっかりサポートし、菌活に取り組む方に安心して続けられる商品です。国内GMP認定工場で製造されており、品質管理も徹底。1日1粒で簡単に善玉菌を補給でき、健康的な腸内環境づくりを助けます。

10位：酪酸菌Rich 菌活サプリ

高濃度酪酸菌で腸も美容もサポート！

菌活 サプリのおすすめランキングの第10位は「酪酸菌Rich 菌活サプリ」です。

▼商品概要
本商品は、菌活に特化したサプリメントで、酪酸菌8億個をはじめ乳酸菌、ビフィズス菌、さらに生酵素やコンブチャを含む厳選された16種の成分をバランスよく配合しています。オリゴ糖やこうじ酵素、美容成分9種も加わり、腸内環境のサポートと美容ケアを同時に実現。毎日手軽に菌活を始めたい方にぴったりで、高濃度の酪酸菌配合により腸内フローラの改善をしっかりサポートします。30日分の容量で続けやすく、健康維持を目指す方におすすめです。

11位：morinaga 生きて届くビフィズス菌BB536 30日分

森永乳業の50年研究！生きて届くビフィズス菌で腸活サポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第11位は「morinaga 生きて届くビフィズス菌BB536 30日分」です。

▼商品概要
本商品は森永乳業が50年以上の研究で培ったビフィズス菌BB536を1粒に凝縮した、機能性表示食品の菌活サプリです。ビフィズス菌BB536は酸や酸素に強く、大腸まで生きて届くため効率よく腸内環境を改善し、腸の調子を整えます。毎日手軽に続けやすい30日分のカプセルで、腸内の善玉菌バランスを整えたい方に最適なサプリメントです。菌活を始めたい方や、健康維持を目指す方におすすめします。

12位：新日本ヘルス 炭と菌のすっきり生酵素 30粒

498種の酵素と菌で内側からすっきり美活！

菌活 サプリのおすすめランキングの第12位は「新日本ヘルス 炭と菌のすっきり生酵素 30粒」です。

▼商品概要
本商品は、植物発酵エキス439種類と穀物麹7種類をはじめ、炭4種と乳酸菌22種類を贅沢に配合したサプリメントです。内側から腸内環境を整え、毎日のスッキリ感をサポートするために設計されており、特に菌活に力を入れる方に最適です。さらにブラックジンジャーやサラシア、カルニチンなどのダイエットサポート成分も含まれているため、健康的な体形維持にも役立ちます。1日1粒で手軽に多種多様な酵素と乳酸菌を補給できるのが最大の魅力です。国内GMP認定工場で製造されており、安全性と品質にもこだわっています。

13位：菌トレ習慣 菌トレ習慣 HYPER 乳酸菌サプリメント

20兆個の乳酸菌で腸内美活をサポート

菌活 サプリのおすすめランキングの第13位は「菌トレ習慣 菌トレ習慣 HYPER 乳酸菌サプリメント」です。

▼商品概要
本商品は、1袋で20兆個もの乳酸菌を摂取できる菌活サプリメントです。ビフィズス菌、乳酸菌、酪酸菌など多彩な善玉菌を配合し、腸内環境のバランスを整えるために役立ちます。さらに、ラクトフェリンやオリゴ糖、竹炭、キトサンといった善玉菌の働きを支える成分も含まれており、体内フローラの改善と健康的な腸内環境の維持に大きく貢献します。ヨーグルト風味で飲みやすく、毎日続けやすいのも魅力です。安心の国内GMP認定工場で製造されているため、品質にも信頼が持てます。菌活を本格的に始めたい方におすすめのサプリメントです。

14位：DMJえがお生活 わたしの菌活きのこ粒

13種きのこで続ける菌活サポート！

菌活 サプリのおすすめランキングの第14位は「DMJえがお生活 わたしの菌活きのこ粒」です。

▼商品概要
本商品は、13種類の厳選されたきのこ由来の有用成分を凝縮したサプリメントで、菌活をサポートします。霊芝、チャーガ、アガリクスなどのきのこに含まれるβグルカンやキノコキトサンを効率的に取り入れられるため、腸内環境を整えたい方に最適です。さらに、素材の吸収を助けるヒハツも配合されているため、毎日の健康維持に役立ちます。小粒で飲みやすく、1日2粒の手軽さも魅力です。菌活を続けたい方が無理なく続けられる設計が最大の特長です。

15位：MyWellsy 乳酸菌ビフィズス菌サプリ 30日分

5兆個の菌で手軽に続ける本格菌活サプリ

菌活 サプリのおすすめランキングの第15位は「MyWellsy 乳酸菌ビフィズス菌サプリ 30日分」です。

▼商品概要
本商品は、菌活をしっかりサポートする【生きた乳酸菌配合 薬剤師監修】MyWellsy 乳酸菌 ビフィズス菌サプリです。6種のブランド菌を含む28種類の乳酸菌・ビフィズス菌を合計5兆個配合し、さらにオリゴ糖やイヌリン、ナットウキナーゼなど腸内環境を整える成分も豊富に含まれています。1日1粒で100gのヨーグルト150個分の乳酸菌が摂取でき、耐酸性カプセルにより菌が胃酸に負けず腸まで届くため、効率的に菌活を続けやすいのが特長です。創業234年の製薬会社と薬剤師が共同開発し、品質管理の行き届いた国内GMP工場製造で安心して毎日の健康維持に取り入れられます。

「菌活 サプリ」についてのよくある質問

Q. 菌活サプリって何ですか？

A. 菌活サプリは、腸内環境を整えるための善玉菌やそのエサとなる成分を含んだ健康補助食品です。

Q. 菌活サプリはどのくらいの期間飲めば効果がありますか？

A. 個人差はありますが、一般的には最低でも1ヶ月以上継続して飲むことで効果を感じやすくなります。

Q. 菌活サプリはいつ飲むのが効果的ですか？

A. 食後30分以内に飲むと腸に届きやすく効果的とされていますが、商品によって異なる場合があるので説明書を確認してください。

Q. 菌活サプリは副作用がありますか？

A. 基本的には安全ですが、体質によってはお腹がゆるくなることがあります。心配な方は医師に相談してください。

Q. 菌活サプリだけで腸内環境は良くなりますか？

A. 菌活サプリは補助的な役割です。バランスの良い食事や適度な運動と組み合わせることでより効果的になります。